然后,利用优化的节瓜SCoT-PCR反应体系对36条SCoT引物进行筛选,首次筛选到了应用于节瓜中的SCoT引物并对部分引物的退火温度进行优化。通过实验与分析,确定了节瓜SCoT-PCR反应体系是DNA模板(25 ng/μL) 2.5 μL、2× sanTaq PCR mix预混液11 μL、引物(10 μmol/L) 2 μL,筛选到了14条适合在节瓜的ISSR发现更多-PCR反应中应用的引物以及得到了它们的最适退火温度。与此同时,经验证该体系在节瓜应用具有良好的适用性、可靠性和稳定性。
纳米孔道单分子检测技术通过在纳米孔道中捕获分子穿过时产生的离子流变化信号来研究单个分子的信息。然而,由于纳米孔道对不同分子的捕获率不同,因此采集得到的单分子数据集不平衡,进而影响分子识别的准确率。本文基于可能编码DNA分子的阻断事件,构建以深度卷积生成式对抗网络(DCGAN)为基本框架的模型,实现少数类样本的扩充,从而达到纳米孔道数据集的平衡处理。进一步,采用QuipuNet对平衡前后数据集进行训练和识别。结果表明,采用DCGAN平衡数据集后,训练后的QuipuNet对部分“100”编码分子的识别准确率提升了14%,且平均识别准确率均高于其他beta-catenin phosphorylation扩充数据集的方法,验证了采用DCGAN方法扩充编码DNA分子数据以平衡数据集可有效提高模型训练后对实际信号的识别准确率。
复制和转录机器会同时使用相同的DNA区域作为模板,因此复制和转录不可避免地以头对头或追尾方式相互碰撞。头对头碰撞和追尾碰撞均会导致复制机器停留,从而造成DNA损伤和基因组不稳定。就基因组完整性而言,头对头碰撞比追尾碰撞的后果更严重。本文回顾总结了复制-转录冲突的解决机制和进化影响。